GENOS FOR BREEDING

以水稻为标杆,
让育种能力持续积累。

数据×模型×验证

围绕具体的育种任务,结合组学数据、模型分析与实验验证。
以水稻为起点,与育种团队共同探索更多性状和物种。

一个水稻标杆,一套合作范式,逐步拓展更多物种。

水稻与DNA双螺旋
BSI 动植物育种 · 建设方案为什么这件事可行 ↓
01 / GENOS-RICE已有研究与业务起点

Genos-rice:
模型、数据与研究表现。

从水稻种内多样性学习序列规律,
为任务适配和企业合作提供起点。

已公开研究

OneGenomeRice 水稻基因组基础模型

论文

以自监督序列预训练形成表征,再连接任务数据与分析模块,研究基因组片段、功能线索和表达变化。

1.25B模型总参数
422公开水稻基因组
1Mb最长上下文
1nt单碱基输入精度
染色质开放区域识别512bp基准任务 · AUC
0.838
留出品种的基因表达预测12条染色体分别统计 · log表达Pearson r
0.91–0.95
DNA与ATAC多模态表达建模
已有

物种模型与评测经验

422个公开基因组覆盖栽培稻与野生稻。已有研究涉及籼粳渗入识别、Wx/ALK位点线索和表达预测。

连接

组学、计算与验证资源

BSI按具体项目组织测量、分析与实验伙伴,把分散能力组合成可交付的任务产品。

补齐

客户问题与应用证据

在真实育种场景中确认决策需求、授权数据与验证终点。研究结果需要进一步证明企业使用价值。

相关系数与AUC分别对应特定研究任务,不等同于育种性状准确率。表达模型的任务窗口为32kb,并非所有下游任务都使用1Mb。

02 / THE COMBINED PRODUCT产品与实现流程

一项育种任务,
数据、模型与验证共同交付。

围绕客户的一项决策组织能力。
具体任务由调研与资源条件确定。

方案示例 · 待场景确认

让历史分型与新测序数据共同进入育种分析,减少重复整理和返工。

01 / DATA

数据

参考数据、样本与位点对应关系,以及质量和版本规范。

02 / MODEL

模型与工具

适用的分型补全与分析模块,接入企业现有流程。

03 / VALIDATION

验证能力

独立真值、现用流程对照与质量检查,核算全链条成本。

客户得到可直接使用的数据、可复核的质控结果和后续使用方法。
  1. 走进场景
  2. 定义任务与权利
  3. 组合数据和工具
  4. 对照验证与交付
  5. 反馈与产品更新

模型按任务选用。Genos-rice、其他模型与传统方法均通过对照评测确定用途。

03 / BUSINESS VALUE为什么能带来收入

企业持续有任务,
产品就要持续有用。

从重复发生、成本可核算的问题切入。
用实际价值支持续用和续费。

企业为什么买

购买一项问题的解决能力

  • 减少重复投入新材料、新批次的数据整理与分析可复用。
  • 让后续试验更有依据适用任务中,提供经验证的候选、指标或分析结果。
  • 结果能够核对约定对照、质量标准、适用范围与验收方法。

华大如何收费

起步

方案定义与任务适配

按明确范围开展合作开发与阶段验证。

重复

样本处理、模块使用、验证检测

围绕客户每批、每季发生的任务持续交付。

延续

更新维护与新增任务

有稳定需求后,约定年度使用或模块许可。

商业成立的条件

客户节省或获得的价值可核对;收费能覆盖检测、计算、专家与维护成本;同类项目复用后,交付投入逐步下降。

04 / LEARNING FROM EACH TASK数据、工具与验证经验

数据、工具与验证经验,
在真实任务中逐步积累。

把数据规格、分析流程和验证记录整理为可复用的资源。
在约定的范围内用于后续任务,并通过评测持续改进 Genos。

数据与成果的使用

客户专属数据按合同隔离;进入共用数据、评测或模型更新的内容,需有明确授权。数据、标签和失败记录须经过质控,才能用于后续开发。

05 / FIRST THREE MONTHS三个月先完成什么
拟定目标 · 进入场景与形成方案

找准一个真问题,
形成一套合作范式。

意向伙伴、真实痛点、组合产品方案。
为下一阶段付费试点准备条件。

第一个月 / 进入场景

把问题问实

接触约6家相关企业或机构,深入走查或访谈至少2个实际业务场景。

留下什么问题清单、实际案例、现用方法与成本线索
第二个月 / 确认任务

把伙伴和任务定准

争取1–2家意向伙伴,选择1个水稻任务,核清数据、验证条件与双方投入。

留下什么对方确认的需求纪要与任务说明
第三个月 / 形成范式

把合作方案做成

形成组合产品v0与合作模板;用可获得的数据验证1个关键技术环节。

留下什么可复用方案、关键环节结果及下一阶段预算
季度交付

一份可复用的水稻合作方案

数据清单 · 模型路线 · 验证计划 · 双方分工 · 费用与授权 · 阶段验收

CONTACT

聊聊您的育种需求

从一个具体问题开始交流,共同判断数据、模型和验证可以在哪一步提供帮助。

研究对象
关注的物种、目标性状与应用场景
当前难点
现用方法、关键决策与希望改善的环节
合作条件
已有数据、材料、验证条件与推进计划
Genos 团队Genos@genomics.cn

研究资料与应用说明

OneGenomeRice · 水稻基因组基础模型

2026.04.23预印本。1.25B混合专家模型、422个公开水稻基因组预训练;报告序列表征、功能线索与表达预测研究。

OneGenomeRice · 论文列出的代码仓库

代码、模型和许可,以仓库实际发布内容为准。

研究与应用

已有研究提供起点,不能据此证明超过GS、具备跨物种通用效果或已有商业客户。组合产品、收入路径与季度目标为待验证安排。

项目积累可改进参考数据、任务评测、检索、工具与模型适配。只有使用权和数据质量满足条件,并通过独立评测,才考虑进一步更新Genos。数据增加不等于能力必然提高。

授权资产表示可用于后续开发的数据与知识积累,不直接等同当期收入或已确认的财务资产。客户数据不默认归华大所有。

ONEGENOMERICE

Genos-rice 研究与技术

数据水稻种内多样性

257个栽培稻、165个野生稻基因组

预训练12层Transformer MoE

学习DNA序列与上下文规律

表征按输入选择专家

8个专家,每个token选择2个

适配连接具体任务

分类、候选线索与表达建模

基因组预训练、模型结构与下游任务

为什么做水稻专用模型

通用基因组模型提供跨物种基础。OGR进一步聚焦水稻的种内变异、群体结构与局部序列规律,为特定物种的任务适配提供表征。

总参数 / 激活参数
1.25B / 0.33B
结构
12层 · 8专家 · Top-2路由
注意力与位置编码
GQA · RoPE
序列处理
单碱基输入,最长约1Mb
表达任务上下文
32kb,以转录起始位点为中心
训练数据
422个公开高质量基因组,190个有专业注释

从基础模型到下游任务

可提取预训练表征并连接分类或回归模块;表达任务可加入解码器。DNA+ATAC任务则增加开放信号编码和跨注意力融合。

依据:论文第5、21–22、28–30、39页。规格描述基础能力,不能直接推导企业成本或育种收益。

研究依据:OneGenomeRice,2026年4月23日预印本。查看论文 ↗

论文原图

查看原尺寸图片 ↗OneGenomeRice · 原始论文 ↗